Bei manchen Intel-Systemen (Z77-Chipsätze bspw.) wird "ab Werk" RAID konfiguriert, damit man SSD-Caching benutzen kann.
Wenn du nichts geändert hat, muß die RAID-BIOS-Meldung schon immer gekommen sein!
Das das System nach Änderung auf "AHCI" nicht mehr hochfährt ist normal, da dann der vom Windows verwendete Treiber nicht mehr zum Controller passt. Ich würde es so lassen, wenn es schon so war.
Stört dich das RAID, warum auch immer, kannst im BIOS auf AHCI umstellen. Damit Windows dann noch startet, mußt du zuvor eine kleine Änderung in der Reistry vornehmen: unter HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\services\msahci muss der Wert "Start" auf "0" gesetzt werden. Anschließend neu starten und das BIOS entsprechend ändern. Jetzt startet Windows normal, evtl. ist noch ein Reboot notwendig, da die Laufwerke neu erkannt werden. Wichtig ist das abschließende installieren der Intel-Chipsatztreiber, da die etwas mehr Performance haben, als die Standard-Windows-Treiber.
Alternativ kannst du auch neu installieren, macht viel Arbeit und ändert am Ergebnis nichts.
Gruß Kai