Merkwürdig. Mit einem in den Chipsatz integrierten USB3-Controller konnte ich noch nicht testen, aber da hier wie bei anderen USB3-Controllern Ports für SuperSpeed und High-Speed vorhanden sind, sollten Nicht-SuperSpeed-Geräte an den "H"-Ports des xHCI-Controllers erscheinen. Vielleicht hat sich aber auch Intel hier einfach für ein anderes Vorgehen entschieden. Ein USB3-Stick sollte den Beweis liefern können, dass die blauen Ports wirklich SuperSpeed können...
Mit SuperSpeed gibts oft Probleme - manche Kombinationen wollen einfach nicht zusammen. Anfangs gabs endlos Firmware- und Treiber-Updates, inzwischen sollte eigentlich alles soweit gereift sein, dass wenigstens bei Nutzung des mitgelieferten Anschlußkabels SuperSpeed problemlos funktioniert.
Schau doch mal bei Western Digital, ob es ein Firmware-Update für Deine Platte gibt:
http://support.wdc.com/product/download.asp?level1=1&lang=en